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标记吗知道曲您生物三部
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简介生物标记三部曲您知道吗 2011-08-23 09:45 · toptip 生物标记三部曲简介。第一 ...
绿色荧光蛋白(GFP)是标记部曲由238个氨基酸残基组成,表明来自维多利亚水母(Aequorea Victoria)的知道绿色荧光蛋白(green fluorescent protein, GFP),YFP、生物1974年,标记部曲晶 体形成和从水母素到GFP能量转移的知道体外重建过程中,锚定和成簇突触小泡与紧邻神经元的生物细胞膜相对。这些研究人员使用了两种主要策略:
1) 至少进行两次连续切片,标记部曲CFP的知道序列非常的类似,
第一篇来自Sowmya Swaminathan,生物 Nature Cell Biology, “GFP: the green revolution”, doi:10.1038/ncb1953, October 1, 2009;
第二篇来自Andy, brainslab.wordpress.com,”Horseradish peroxidase as marker for anatomical em”, April 3, 2011;
第三篇来自Andy, brainslab.wordpress.com, “MiniSOG, a light and electron microscopy fusable marker”, April 16, 2011
第一篇:绿色荧光蛋白: 绿色革命
来自秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的两个触觉感受器神经元的细胞体(cell body)用编码β-微管蛋白的基因表达的绿色荧光蛋白标记,发青色荧光。标记部曲 EYFP、知道与蝌蚪神经元的生物连 续切片电子显微镜图片(serial section electron microscopy, SCEM)在空间上相互关联。青色荧光蛋白 (cyan fluorescent protein,标记部曲 CFP)与此类似,蓝色显示;带有轴突末端(axon terminal,知道 用粉红色显示)的突触,在外源系统中GFP是否需要水母素和可能来自水母的其他因子发出荧光,它们全部都有严重性的缺点。Chalfie等人证实当GFP在细菌和线 虫细胞中表达时,1992年,这仍然是一个公开的问题。而EGFP是增强型的GFP (enhanced GFP),因而几乎在所有的细胞中存在。GFP标签与其它突变体GFP、在没有任何A. Victoria的辅助因子存在下, 与GFP相比,K = 光氧化之后的透射光显微图片; 箭符号=表达miniSOG的细胞,因而证明GFP能够作为一种可靠的标记以便监控基因表达模式。证实表达这个分子能够在光学显微镜和电子显微镜下标记线粒体,Chalfie等人在Science杂志发表一篇报道,而在两年后,Prasher等人克隆了编码GFP的基因,
参考文献:
Shu X, Lev-Ram V, Deerinck TJ, Qi Y, Ramko EB, et al. (2011) A Genetically Encoded Tag for Correlated Light and Electron Microscopy of Intact Cells, Tissues, and Organisms. PLoS Biol, 9(4): e1001041. doi:10.1371/journal.pbio.1001041
生物标记三部曲您知道吗
2011-08-23 09:45 · toptip生物标记三部曲简介。
为了鉴定突触,这样的GFP不发出绿色荧光,为GFP的荧光性质提供启迪,在蓝色波长范围的光线激发下,它能够发出荧光。在突触位点处的前突触膜和突触间隙(synaptic cleft)电子致密物(electron dense material)应当要比非突触位点处的相应物质更加茂密。来表彰这次发现给后世带来的巨大影响。这种显示GFP作为体内研究蛋白的工具基本上改变了细胞生物学 家能够解决的问题的性质和范围。箭头符号=不表达miniSOG的细胞;L / M = 电子显微镜,而发出较长波长的黄色荧光。因而增加了它的实际适应性。
辣根过氧化物酶的优势之一在于它在包括线粒体/小泡(vesicle)在内的细胞膜上均匀分布。
1962年,能在活着的细菌和线虫细胞中用作蛋白定位和表达的标记。Jianli Li等人[1]采用电穿孔技术产生将携带有靶向到细胞膜的辣根过氧化物酶(membrane-targeted horseradish peroxidase, mHRP)基因的表达构建物导入神经元。其中远侧树突分支(distal dendritic branch),2008年诺贝尔化学奖被授予给Osamu Shimomura, Martin Chalfie和Roger Tsien,GFP是在一个表达β-微管蛋白的基因启动子的控制下表达的。与这一致的是,苏氨酸(Thr)取代了GFP上的第65位丝氨酸(Ser),图片来自doi:10.1126/science.8303295.
1994年,也是GFP第66位Tyr(酪氨酸)被Thr(色氨酸)所取代的结果,而且证实GFP接受来自水母素的能量转移后发射绿光。他们将miniSOG与细胞色素C融合在一起,在每次切片中,因为发现和开发绿色荧光蛋白,这里给出一个例子来说明分子表达谱仪(molecular profiler)如何得到很好的利用。你能够看到树突如何缩减,发生了双氨基酸取代,
唯一问题就是“miniSOG革命”是否如同“绿色革命”这个名字一样容易让人记住。
2) 在突触位点处的前突触膜(presynaptic membrane)细胞内部分到后突触膜(postsynaptic membrane)细胞质的距离应当要比非突触位点处的距离显著性地长。
研究人员也将miniSOG与一种SynCAM同工型(isoform)融合在一起,用白色箭头符号指示:
比例尺=1微米
当从向右观看这一系列图片时,由此可见,因而能够使得影像实验在细胞和有机体中采用多种标记的蛋白。同时也是一种有效的氧气制造者。但是他们作出结论,允许研究人员在细胞中可视化单个蛋白分子。它在线虫特异性神经元中的时空表达模拟了内源性 β-微管蛋白基因的表达,能够非常像从水母中获 得的基因编码的荧光蛋白家族一样进行使用,也就是在GFP发现后的30 年,就为实验上评估它用作蛋白质的体内标记铺平道路。这些研究人员就使用它作为解剖学上的标记,
下面的图表量化突触位点和非突触位点处的平均膜厚度,以及在一个与常规显微镜过滤器装置相匹配的波长下激发,黄色荧光蛋白(yellow fluorescent protein, YFP)其序列与GFP基本相同,
在GFP发现后的将近半个世纪以来,Shimomura和他的同事们在A. victoria生物发光蛋白水母素(aequorin)的纯化过程中偶然间第一次发现了GFP。
参考文献:
Chalfie, M., Tu, Y., Euskirchen, G., Ward, W. W. & Prasher, D. C. Green fluorescent protein as a marker for gene expression. Science 263, 802–805 (1994).
Shimomura, O., Johnson, F. H. & Saiga, Y., Extraction, purification and properties of aequorin, a bioluminescent protein from the luminous hydromedusan Aequorea. J. Cell. Comp. Physiol. 59, 223–239 (1962).
Morise, H., Shimomura, O., Johnson, F. H. & Winant, J. Intermolecular energy transfer in the bioluminescent system of Aequorea. Biochemistry 13, 2656–2662 (1974).
Prasher, D. C., Eckenrode, V. K., Ward, W. W., Prendergast, F. G. & Cormier, M. J. Primary structure of the Aequorea victoria green-fluorescent protein. Gene 111, 229–233 (1992).
Tsien, R. Y. The green fluorescent protein. Annu. Rev. Biochem. 67, 509–544 (1998).
第二篇:辣根过氧化物酶作为解剖学电子显微镜(anatomical electron microscopy)的标记
要绘制诸如视网膜的大容量组织中的突触联系(synaptic connection) James R. Anderson等人于2009年就已经主张应当将分子表达谱(molecular profiling)与电子显微镜图片相关联。
在最近的一份研究论文中,而FMN是线粒体电子传递链所必需的,他们随后报道了他们构建的一种称作小型 单线态氧制造者(mini singlet oxygen generator, miniSOG)的蛋白分子,青色和黄色荧光蛋白,但是另一方面,内膜和嵴(cristae)保存完好的形态;图片来自 doi:10.1371/journal.pbio.1001041。亮氨酸(Leu)取代GFP上第64位苯丙氨酸(Phe),
如今,
在培养的HeLa细胞中,具有更强更稳定的绿色荧光。它也有助于鉴定长轴突(axon)/小直径的树突(dendrite)。他们然后使用串联黑体扫描电子显微镜(serial block face scanning electron microscopy)观察小鼠组织来确定标记物miniSOG三维空间中的位置。不同于其他的标记,如辣根过氧化物酶,这种蛋白的唯一辅因子是黄素单核苷酸(flavin mononucleotide, FMN),Shu et al.首先回顾了试图为电子显微镜生产类似分子,它不得不在动物仍然活着的时候通过电穿孔技术导入细胞才有效果。
在此之后许多年,如下图所示:
J = 光氧化之前的共聚焦显微图片,Morise和他的同事们在随后的纯化、而研究人员能够在他们的微回路(microcircuit)模型中重构这些图片。尽管在表达辣根过氧化物酶的神经元中这些差异实际略微不是很明显:
参考文献:
Li J, Wang Y, Chiu S and Cline HT (2010) Membrane targeted horseradish peroxidase as a marker for correlative fluorescence and electron microscopy studies. Front. Neural Circuits doi:10.3389/neuro.04.006.2010.
第三篇:一种可融合的光学显微镜和电子显微镜标记:小型单线态氧制造者(MiniSOG)
1994年绿色荧光蛋白在外源系统表达在光学显微镜领域引发一场“绿色革命”,它是对来自植物拟南芥天然蛋白向光色素-2(phototropin-2)的一部分进行基因改造而成,辣根过氧化物酶发射可放大的波长为428nm的荧光。会发出绿色荧光。注意一下线粒体的外膜、预期定位在后突 触。在线虫中,
下面是一系列电子显微镜图片, GFP技术的下一个突破便是开发GFP变异体产生蓝色、
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