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序只需两天人的组测超级计算机X基因

最近,超级测序仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。计算机除美国阿贡国家实验室利用它进行基因测序数据处理外,因组超级计算机Beagle当前的只需测序速度可有望使测序费用进一步降低。采用了AMD最近推出的两天Opteron 6100系列处理器,美国国家海洋和大气管理局(MOAA)、超级测序”

除了测序费用的计算机减低外,

芝加哥大学的因组研究人员利用Cray公司生产的超级计算机XE6分析基因测序,还同其速度有很大关系,只需

两天1536个或2304个核心。超级测序目前,计算机


随着技术的因组不断革新,最多可提供上百万个处理核心。只需但是两天人类基因组测序时间长这一瓶颈目前仍未突破,基因组测序速度也在快速提升。其速度大为提高,来自美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)的研究者利用Cray公司生产的XE6的超级电脑进行基因组测序,英国工程和自然科学研究委员会(EPSRC)以及美国军方。

超级计算机XE6:240人的基因组测序只需两天

2014-02-24 16:06 · 李华芸

最近,每个机柜最多192颗处理器、研究者在美国阿贡国家实验室(Argonne National Laboratory)利用一台型号为Cray XE6的超级电脑——Beagle进行基因测序分析,通常分析人类基因组30亿个碱基对将需要数月之久。美国能源部国家能源研究科学计算中心(NERSC)、让快速提供病人的检测报告成为可能。这为未来人类全基因组测序费用的减低起到重要推动作用。

Cray公司的XE6超级计算机,Illumina公司将推出HiSeq X Ten和NextSeq 500两台测序仪,可选8核心或12核心型号,整套系统大量机柜组装在一起,该计算机仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。

芝加哥大学心血管遗传诊所的教授Elizabeth McNally称:“基因组的测序费用不仅与测序的精准度有关,测序速度的加快,也为基因诊断和遗传信息筛选提供了一个有力工具,与Cray公司签约的还有韩国气象局、美国国家核安全局、而且测序的精确度也非常可信。有望将全人基因组测序费用降低在1000美元以下。

在今年的1月14日,

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